الجهة المنفذة لخطة التعافي هي الوزارة أو أي هيئة مركزية أخرى تابعة للإدارة الحكومية المسؤولة عن تنفيذ استثمارات وإصلاحات محددة في إطار المكون المخصص لها ضمن خطة التعافي والمرونة لجمهورية سلوفاكيا. يقوم الجهة المنفذة بإصدار الدعوات لتقديم العروض، وإبرام العقود مع المستفيدين، ومراقبة تنفيذ المشاريع، كما تتحمل مسؤولية تحقيق المعالم والأهداف التي تبلغ عنها سلوفاكيا إلى المفوضية الأوروبية. ومن بين الجهات المنفذة الرئيسية وزارة البيئة في جمهورية سلوفاكيا فيما يتعلق بتجديد المباني وإزالة الكربون، ووزارة التعليم فيما يتعلق بالتعليم، ووزارة الصحة فيما يتعلق بالمستشفيات، ووزارة النقل فيما يتعلق بالتنقل المستدام. يمكن للجهات المنفذة تفويض جزء من المهام إلى وسطاء، مثل الوكالة السلوفاكية للبيئة في إطار برنامج «Obnov dom». وتقوم الهيئة الوطنية للتنفيذ والتنسيق (NIKA) التابعة لمكتب حكومة جمهورية سلوفاكيا بتنسيق عملية التنفيذ بأكملها. يُعد الجهة المنفذة الشريك الرئيسي للمتقدمين – فهي تحدد شروط الدعوات، وتقدم الاستشارات، وتوافق على المدفوعات، ولذلك من المفيد متابعة موقعها الإلكتروني وإرشاداتها.