تُعد الوظيفة المحاسبية مهمة ضمن نظام إدارة الصناديق، وتكفل إعداد تقارير النفقات والبيانات المالية للبرنامج وتقديمها إلى المفوضية الأوروبية. وفي سلوفاكيا، تتولى وزارة المالية هذه المهمة، وكان يُطلق عليها في الفترات السابقة اسم «هيئة التصديق». وهي تتحقق من اكتمال وصحة النفقات المُبلغ عنها من قبل الهيئة الإدارية، وتتحمل مسؤولية عدم إبلاغ المفوضية بالمبالغ التي تم تحديدها على أنها مخالفات. وبالنسبة للمستفيد، فإن هذه الهيئة ليست الجهة التي يتواصل معها مباشرةً، إلا أن عملها يؤثر على سرعة تدفق الأموال: فلا يتم إعادة الأموال من ميزانية الاتحاد إلى الدولة إلا بعد تقديم التقرير والموافقة عليه. إن فهم هذه السلسلة يفسر سبب إصرار المانح على تقديم وثائق خالية من الأخطاء مع طلب الدفع.
انظر أيضًا: وحدة الدفع، طلب الدفع، نظام الإدارة المالية.
