Systém finančného riadenia je súbor pravidiel, ktorý určuje, ako sa prostriedky z fondov Európskej únie dostávajú od Komisie k prijímateľovi a späť vykazujú. Vydáva ho ministerstvo financií a je záväzný pre všetky orgány zapojené do implementácie. Pre prijímateľa nie je dôležité poznať ho celý, ale rozumieť dôsledkom: schvaľovanie výdavku, jeho úhrada a následné vykázanie voči Komisii sú tri odlišné kroky vykonávané rôznymi útvarmi, čo vysvetľuje, prečo od schválenia žiadosti o platbu po pripísanie peňazí uplynie čas. Systém tiež určuje, aké doklady musí prijímateľ predkladať a v akej štruktúre. Pri plánovaní cash flow projektu preto rátajte s lehotami, nie s okamžitou refundáciou.
Pozri aj: platobná jednotka, žiadosť o platbu (ŽoP), refundácia.
