Prepojený podnik je pri určovaní veľkosti podniku firma, nad ktorou má žiadateľ kontrolu alebo ktorá kontroluje žiadateľa, napríklad vlastní väčšinu hlasovacích práv alebo môže menovať väčšinu štatutárov. Údaje prepojených podnikov sa k žiadateľovi pripočítavajú v plnej výške. Prepojenie môže vzniknúť aj cez spoločných vlastníkov, ktorí sú fyzické osoby.