Partnerský podnik je pri určovaní veľkosti podniku firma, v ktorej má žiadateľ podiel 25 až 50 % alebo ktorá má takýto podiel v ňom. Údaje o zamestnancoch a obrate partnerského podniku sa pripočítavajú pomerne podľa výšky podielu. Nesprávne započítanie partnerských podnikov je častým dôvodom, prečo firma stratí status MSP a nárok na vyššiu podporu.
