Monitorovací výbor je orgán, ktorý dohliada na vykonávanie programu a schvaľuje kľúčové dokumenty – predovšetkým kritériá na výber projektov, výročné správy o vykonávaní a zmeny programu. Zasadá niekoľkokrát ročne a jeho členmi sú okrem zástupcov riadiaceho orgánu aj partneri: samosprávy, zamestnávateľské zväzy, odbory, mimovládne organizácie, akademický sektor a zástupcovia Európskej komisie s poradným hlasom. Pre žiadateľov je výbor zaujímavý z jedného konkrétneho dôvodu – materiály a zápisnice zo zasadnutí bývajú verejné a odhaľujú, aké kritériá sa pripravujú a aké výzvy sa chystajú, často mesiace pred ich vyhlásením. Ide o jeden z najlacnejších zdrojov informácií pre plánovanie projektových zámerov. Rovnako sa z nich dá vyčítať, ktoré opatrenia zaostávajú v čerpaní, čo býva signálom, že poskytovateľ pripravuje ďalšie kolo.
Pozri aj: hodnotiace kritériá, riadiaci orgán, zásada partnerstva.