Nadnárodná spolupráca je časť územnej spolupráce, ktorá spája partnerov z väčšieho počtu krajín v rámci makroregiónu, nie len z bezprostredného pohraničia. Slovenské subjekty sa zapájajú najmä do programov pre podunajský priestor a strednú Európu. Financujú sa z nich témy, ktoré presahujú hranice jedného štátu – ochrana vodných zdrojov, adaptácia na zmenu klímy, doprava, inovačné ekosystémy, cestovný ruch a sociálne inovácie. Projekty sú prevažne takzvané mäkké: výstupom bývajú stratégie, metodiky, pilotné overenia a siete spolupráce, nie stavby. Žiadateľmi sú samosprávy, univerzity, výskumné a rozvojové agentúry a niekedy aj podniky. Podanie si vyžaduje partnerstvo z niekoľkých krajín a komunikáciu v angličtine počas celej realizácie.
Pozri aj: Interreg, cezhraničný projekt, EZÚS.
