Dotácie na vodu a kanalizáciu podporujú budovanie a modernizáciu vodárenskej infraštruktúry a opatrenia na zadržiavanie vody v krajine. Do prvej skupiny patria vodovody, kanalizačné siete a čistiarne odpadových vôd, do druhej vodozádržné opatrenia v obciach a v krajine, zachytávanie zrážkovej vody, obnova mokradí a protipovodňová ochrana. Žiadateľmi sú prevažne obce, vodárenské spoločnosti a správcovia tokov, pri opatreniach na zeleni aj školy a organizácie. Ide o kapitálovo náročné projekty so silnou väzbou na prípravu: bez právoplatných povolení, vysporiadaných pozemkov a projektovej dokumentácie sa žiadosť podať nedá. Práve príprava dokumentácie býva úzkym hrdlom, preto obce, ktoré ju majú hotovú vopred, dokážu reagovať aj na výzvy s krátkym termínom.
Pozri aj: dotácie pre obce a mestá, zásobník projektov, prílohy žiadosti o NFP.
