Centrálny koordinačný orgán (CKO) je útvar Ministerstva investícií, regionálneho rozvoja a informatizácie SR, ktorý zastrešuje jednotný metodický rámec pre čerpanie fondov EÚ na Slovensku. CKO vydáva Systém riadenia fondov EÚ, metodické pokyny, výkladové stanoviská a záväzné vzory dokumentov – od vzoru výzvy cez zmluvu o poskytnutí NFP až po formuláre monitorovacích správ. Tieto dokumenty sú záväzné pre všetky riadiace a sprostredkovateľské orgány, čím sa zjednocuje postup naprieč programami. CKO zároveň spravuje informačný systém ITMS, koordinuje prípravu programového obdobia a sleduje tempo čerpania voči záväzkom voči Európskej komisii. Pre žiadateľa je CKO praktický zdroj: ak sa výklad výzvy líši od metodiky CKO, prednosť má metodika, na ktorú sa výzva odvoláva. Pred podaním žiadosti sa preto oplatí overiť aktuálne znenie príslušného metodického pokynu, keďže sa v priebehu obdobia dopĺňa a mení.
Pozri aj: Program Slovensko 2021–2027, riadiaci orgán (RO), ITMS21.