Platba z plánu obnovy funguje na inom princípe než klasické eurofondy. Členský štát nepredkladá Európskej komisii doklady o vynaložených výdavkoch, ale preukazuje, že splnil dohodnuté míľniky a ciele. Komisia plnenie posúdi a až potom uvoľní príslušnú časť prostriedkov. Tomuto výkonnostnému princípu sa hovorí platba viazaná na výsledok a znamená, že nesplnenie jediného míľnika môže pozastaviť celú platbu vrátane opatrení, ktoré prebiehajú bez problémov. Na národnej úrovni sa prostriedky prijímateľom vyplácajú podľa vlastných pravidiel systému implementácie, teda zálohovo alebo refundáciou. Prijímateľ preto pracuje s dvoma vrstvami termínov naraz – vlastnou zmluvou a nadradeným harmonogramom míľnikov, ktorý nevie ovplyvniť. Rozumným postupom je preto počítať s časovou rezervou a nespoliehať sa na to, že zdržanie na strane štátu automaticky posunie termíny uvedené v zmluve.
Pozri aj: žiadosť o platbu, systém implementácie plánu obnovy.
